依托国家级工程实践教育中心和教育部卓越工程师培养计划，与企业联合培养掌握扎实生物学、化学和工程学的基本理论和实验技能，可在发酵工程、生物制药、生物化工、生物食品和基因工程领域中，从事生物工程与工艺设计、微生物反应过程控制、生物提取与分离等研发、技术管理工作和生物制品营销工作的高级技术人才。主要课程：生物工程概论、生物化学、生物化学实验、化工原理、化工原理实验、微生物学、微生物学实验、生物工艺学及实验、生物分离工程、生物分离工程实验、发酵设备、工厂设计、分子生物学与基因工程、生物反应工程、工业发酵分析、药品及食品GMP标准及认证、过程控制与自动化仪表、氨基酸工艺学、食品安全与检测。