安全工程专业是中国唯一的海洋安全特色专业。专业立足于学校“航运、物流、海洋”的发展特色，服务于国家“一带一路”和“海洋强国”战略，致力于践行国际海事组织（IMO）的“SaferShipping，cleaner Ocean”使命，培养以海洋安全为特色的高级专业人才，是国际知名的“人-机-环境-管理”安全系统理论的诞生地。本专业以培养具备安全工程师素养的高级技术骨干和管理人才为目标，注重事故灾害的预防和控制方法的教育教学，注重开展安全科学与工程理论、方法和技术的教育教学，强化航运、物流和海洋领域的安全工程应用能力和实践能力，是上海市应用型本科试点建设专业。
主要课程：流体力学、燃烧学、工程事故传热学、计算机辅助工程绘图、安全学原理、安全系统工程、安全管理学、安全经济学、安全人机工程学、船舶火灾与爆炸灾害控制工程、风险分析与安全评价、安全监测技术、电气安全工程技术、事故调查与分析、现代消防技术、海运安全科学技术、公共安全与应急管理、职业卫生与防护等。
就业方向：毕业生除继续深造外，主要从事安全技术及工程管理、安全科技研发、安全检查与管理、安全检测与监测、安全设计与评估、事故灾难应急技术及管理、安全教育与培训等方面的工作，主要服务于政府各级安全与应急管理部门、交通运输安全管理部门、海事管理部门、消防部门、大型制造业、科研院所、大专院校及安全评价与咨询机构。培养懂技术、会管理，具有国际视野的复合型高级应用工程技术人才。主要合作单位有：上海市及各区县应急管理局、上海海事局、上海消防局、沪东中华船厂、外高桥船厂、江南重工、中远集团、中国海运集团、中国外运集团、上汽集团、上海化工区、华谊集团、上海国际港务集团等。