环境生态工程是融合生态学、环境科学与工程前沿交叉领域的新兴专业。随着国家生态文明建设战略的实施，对专业人才的需求与日俱增。本专业培养具备生态学、环境科学和工程设计等方面的基本理论、基础知识和工程治理的基本技能，掌握扎实的环境生态工程专业专门知识，掌握环境要素、生态因子效应分析的方法，具备环境生态工程规划、设计和管理等专业技能，在湿地生态保护与修复方面具有专业特长的复合应用型人才。
本专业核心课程包括保护生物学，生态模拟，生态系统模拟实验，湿地学，生态水文学，环境工程原理，生态工程原理实验，生态工程学，生态修复工程学，景观生态学，大气污染控制工程，流域污染控制与管理，土壤污染防治与生态修复，生态监测与评价等。本专业毕业生可在环境与生态保护相关的企、事业单位或教育行业等相关领域从事环境生态环境监测、生态修复与建设、生态环境工程规划与设计、教育、咨询和管理等方面工作。
本专业现有教师17人，其中高级职称7人。具有博士学位的教师为14人，拥有市级领军人才梯队2个。本专业将以学院“黑龙江省寒区湿地生态与环境研究重点实验室”、“哈尔滨湿地研究院”等特色平台为依托服务于生态强省目标，打好湿地生态特色品牌。
本专业学制四年，符合学位授予条件的毕业生授予工学学士学位。