制药工程是综合运用化学、药学（含中药学）、化学工程与技术、生物工程等相关学科的原理及方法，研究解决药品规范化生产过程中的工艺、工程、质量与管理等问题的工学学科。药品生产包括原料药和制剂的制造。制药工程专业是适应药品生产需求、以培养从事药品制造的高素质工程技术人才为目标的工科专业。本专业立足重庆，面向全国，为地方经济和社会发展服务，培养具有扎实的制药工程专业基础知识和一定的专业技术能力，具有较完善的知识结构，一定的科研、创新能力，综合素质好，能从事制药工艺设计、新药产品开发，制药生产管理的高级工程师，以及能在生物、食品、环境等领域从事实际工作的应用型高级专门人才或国家机关、各类企事业单位的管理人才。
专业核心课程：药物合成反应、药物化学、制药工艺学、药物分析、药剂学、药理学