生物医学工程是综合生命科学、电子信息学、材料科学等学科的新兴交叉学科，是目前国际上发展极为迅速的交叉学科。本专业基础主要涉及生物信息学、医学影像学、纳米技术、新材料技术等，研究用于人体疾病诊断、治疗为主的人工材料、制品和植入器械，是关系到提高医疗水平和人类自身健康的重要工程领域，是21世纪最具潜在发展优势的学科之一。
本专业拥有一级学科硕士学位授予权，科研条件优越、设备先进，建有国家级教学示范中心、材料先进技术教育部重点实验室和“人工器官表面工程”四川省重点实验室，形成了生物材料、医疗器械、组织工程、人工器官和生物传感器等研究方向。本专业突出创新精神和创新实践能力培养，鼓励学有余力的学生积极参加院校各级科研实践训练、大学生创新创业训练项目、学科竞赛以及教师的科研工作，全力培养具有国际视野及全面竞争力的知识创新型人才。
培养目标：
本专业旨在培养具备坚实的材料科学、生物医学、电子信息学等相关学科理论基础，具有较强的创新精神、工程实践能力和良好的科研素质，能在生物材料、人工器官、医疗器械等生物医学工程领域从事研究与设计、产品与技术开发、工程应用及管理等方面工作的高级科研和技术人才。
主修课程：
生物医学工程基础、材料科学基础、材料成型加工基础、材料性能、生物医用材料、生物医学基础、组织工程与药物控制释放、医疗器械及设计、医疗器械评价与质量控制、生物材料表面工程、生物医学电子与信号处理、生物传感器、医疗仪器与诊断技术等。
实践环节是培养学生能力和素质的重要途径。本专业约有50%的课程都配有实验。此外开设有专业认识实习、生产实习、综合课程设计、机械制造技术基础实习、专业综合实习等实践环节，还可选择参加个性化实验、大学生创新实验项目、重点实验室开放项目等科研实践活动，与国内多家知名企业签署实习协议，在校学习期间还可参与校企共建的实践基地进行实习。
就业方向：
由于生物医学工程属于新兴的交叉学科，与电子技术、生物技术、材料等领域有多方面交叉与渗透，因而培养的人才就业面比较宽。就业的行业覆盖面包括医用材料、医疗制品、植入器械、电子信息行业等工程行业，可从事上述行业的研究与开发、检测与控制、制造与营销、管理与维护等，或在本院或进入国内外相关大学和研究机构进一步深造。2010届免研率：24%；读研率：50.5%；就业率：100%。