环境科学与工程系是我院重点建设和发展的系科，设有环境监测与评价、环境监测与治理技术两个环境类专业，建筑工程技术、建筑装饰工程技术两个建筑类专业，建筑装饰工程技术/园林工程技术双专科专业。该系师资力量雄厚，现有专业教师24人，全部为本科以上学历，硕士研究生学历达12人。现有兼职教授1人，副教授4人，讲师8人，高级工程师1人。实验设施较为完备，环境类专业设有无机化学、有机化学、分析化学、仪器分析、环境微生物、环境监测、环境工程等专业实验室以及大型仪器分析中心，建筑类专业设有建筑制图、计算机辅助设计、建筑力学、建筑材料、电子电工等专业实验室。

　　该系坚持面向行业、面向企业、面向生产第一线的办学方向，实行校企联合，与环境科学研究所、环境监测站、环境工程公司、污水处理厂、自来水公司、垃圾处理厂、发电厂、啤酒厂、建筑设计院、建筑公司、建筑装饰装潢公司、园林公司等多家单位合作，建立实训基地，现有校外实训基地20个以上。

　　除了参加学院组织的专转本、赴韩留学深造外，该系还与扬州大学化学化工学院、资源环境学院紧密合作，学生毕业时可直接到扬州大学进行专接本学习(三年)或独立本科段(二年)深造，为学生开辟了多种升学渠道。

　　该系坚持教学改革，推进素质教育，成立了“绿音环保协会”、“大学生环保志愿者”等多个学生社团，社团成员可推荐加入扬州市环保志愿者协会，深入社区广泛开展环保活动，为扬州市生态城市建设作出了贡献，取得了较好的社会效益。